NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria) Species compatibility

This table includes species compatibility information available to date.

  = Yes.     ■* = Yes. Note that efficiency of depletion may vary depending on sample      = Limited     ■ = No

  COMPATIBILITY REPORTED
  NEB DATA USER DATA
Organism Community Monoculture Community Monoculture
Acinetobacter      
Acinetobacter baumannii (ATCC 17978)     ■*
Acetobacterium woodii       ■*
Actinomyces odontolyticus (ATCC 17982)      
Akkermansia muciniphila      
Bacillus      
Bacillus cereus (ATCC 10987)      
Bacillus megaterium       
Bacteroides fragilis      ■*  
Bacteroides thetaiotaomicron      ■*  
Bacteroides uniformis      ■*  
Bacteroides vulgatus (ATCC 8482)    ■*  
Bifidobacterium adolescentis (ATCC 15703)    
Bifidobacterium longum      ■*  
Blautia obeum      ■*  
Coprococcus comes      
Clostridium beijerinckii (ATCC 35702)      
Clostridium bolteae      
Clostridium perfringes      
Clostridium phytofermentans      
Clostridium saccharolyticum      
Colinsella aerofaciens      ■*  
Cutibacterium acnes (ATCC 11828)      
Deinococcus radiodurans (ATCC BAA-816)      
Dorea formicigenerans      ■*  
Enterococcus faecalis (ATCC 47077)      
Escherichia coli (ATCC 700926)  
Escherichia-Shigella      
Eubacterium rectale      
Fusobacterium nucleatum       
Helicobacter pylori (ATCC 700392)      
Halalkalicoccus jeotgali       
Janthinobacterium lividum      
Lactobacillus gasseri (ATCC 33323)      
Lactococcus lactis      
Lactobacillus paracasei      
Moorella thermoacetica       ■*
Mycobacterium Smegmatis   ■*    
Neisseria meningitidis (ATCC BAA-335)      
Odoribacter splanchnicus      
Parabacteroides merdae      
Parabacteroides distasonis      
Porphyromonas gingivalis (ATCC 33277)      
Prevotella copri      ■*  
Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027)      
Rhodobacter sphaeroides (ATCC 17029)      
Roseburia intestinalis      
Rubrivivax      
Ruminococcus bromii      
Ruminococcus gnavus      
Ruminococcus torques      
Salmonella enterica      
Sporomusa ovata        ■*
Staphylococcus aureus (ATCC BAA-1556)      
Staphylococcus epidermidis (ATCC 12228)    
Streptococcus agalactiae (ATCC BAA-611)      
Streptococcus mutans (ATCC 700610)      
Streptococcus parasanguinis      
Thermoanaerobacter kivui        ■*
Veillonella parvula      
Vibrio cholerae